Michael Scofield (Wentworth Miller) entra em desespero quando o irmão mais novo, Lincoln Burrows (Dominic Purcell), é preso e aguarda execução no corredor da morte. O rapaz foi condenado por um assassinato, mas Michael acredita que Lincoln não o cometeu. Com o tempo cada vez mais apertado, Michael decide assaltar um banco apenas para ser preso e levado até a penitenciária em que o irmão cumpre pena. Agora próximo ao irmão, Michael - que é engenheiro civil e tatuou as plantas da prisão pelo corpo - executa um plano de fuga e assim libertar o irmão para provar a inocência dele.